Hluboko v horách tajné ninja akademie trénují naše budoucí ochránce. Starodávné svitky vypráví o třech vyvolených. O třech, kteří se stanou Strážci Vesmíru - hrdiny, kteří chrání Zemi před Lothorem, zlým ninja mistrem, který ji chce zničit.

Teenageři vysedávají v obchodě extrémních sportů zvaném Storm Chargers, který se nachází v Blue Bay Harbor. Jako Strážci se setkávají v Ninja Operační Základně - tajném, moderně vybaveném podzemním dojo, kde trénují za použití holografických simulací.